Boateng có mẹ là người Đức và cha là người Ghana.[25] Cha của anh, ông Prince Boateng, đã rời Ghana đến Đức năm 1981. Anh có một em gái, Avelina và hai người anh em cùng cha khác mẹ, Kevin-Prince Boateng và George. Jérôme và Kevin đã cãi nhau khá gay gắt sau sự kiện người anh vào bóng thô bạo làm Michael Ballack chấn thương và khiến cầu thủ người Đức này không thể tham dự World Cup 2010. Jerôme tỏ ra thất vọng vì sự bảo thủ của anh mình: "Chúng tôi nhìn nhận vấn đề quá khác nhau, và tôi nói với anh ấy rằng chúng ta đường ai nấy đi" mặc dù anh vẫn dành sự kính trọng cho người anh của mình: "Dù thế nào đi nữa, đó cũng vẫn là anh trai tôi, mặc dù vào giây phút này đây, chúng tôi chẳng biết nói gì với nhau cả".[26]